Functional genomic analysis of Hawaii marine metagenomes
Abstract
对宏基因组高通量测序数据的分析, 是当前研究海洋微生物的重要方法。作者对夏威夷海域不同深度海水的微生物群落宏基因组进行功能基因组学分析。通过基因功能注释, 发现了大量潜在的新基因, 结果也表明极端环境加强了微生物密码子使用偏好。进一步根据光强、氧含量和低温高压等环境因素, 进行代谢通路和基因序列分析, 从分子水平上对海洋微生物与环境的关联和适应性提出若干新的认识, 探讨不同深度海洋环境中微生物特有的生存机制。
